De acuerdo a los protocolos establecido, tras la designación del juez que conocerá la causa de solicitud de extradición del expresidente Juan Orlando Hernández, este deberá aceptar la misma y emitir una orden de captura.
Posteriormente se procede a la captura y el detenido (Juan Orlando Hernández) será presentado ante el juez asignado, donde este estime conveniente.
Tras la audiencia de notificación , el exmandatario debe ser trasladado a un cárcel de máxima seguridad.